Am Rheinauhafen wird ein Hochwasserpumpwerk betrieben. Dieses Pumpwerk leistet einen wichtigen Beitrag zum Hochwasserschutz Kölns. Wenn es stark regnet, sorgt das Hochwasserpumpwerk dafür, dass die Kanalisation nicht überläuft. Normalerweise kann Regenwasser problemlos in den Rhein ablaufen oder über die Kanalisation in Klärwerke weitergeleitet werden. Ist der Regen aber so stark, dass das Wasser nicht schnell genug abfließen kann und die Gefahr besteht, dass die Kanalisation wegen des vielen Wassers überläuft, schaltet sich das Hochwasserpumpwerk ein und pumpt bis zu 3500 Liter Wasser pro Minute in den Rhein. Auf diese Weise wird verhindert, dass das Wasser aus der Kanalisation die Stadt überflutet.